El Consejo Federal del Fútbol Argentino confirmó además que la primera fecha de la fase final se jugará el domingo 12 de abril de 2009, donde Asociación Atlética Estudiantes debutará en San Juan ante Sportivo Del Bono y Atenas recibirá en el estadio "9 de Julio" a Juventud Alianza de San Juan.
Los 16 equipos clasificados fueron divididos en cuatro zonas de cuatro equipos cada una, los que jugarán por el sistema de todos contra todos a dos ruedas, los ganadores de cada zona clasificarán para los play off, que se enfrentarán entre sí y los ganadores ascenderán al torneo Argentino A y los perdedors jugarán la promoción.
Las zonas se conformarán con los equipos clasificados de acuerdo con este ordenamiento: Las zonas 1 y 2 (A); 3 y 4 (B); 5 y 6 (C); 7 y 8 (D). En consecuencia, el grupo C, quedará integrado por Sportivo del Bono de San Juan, Juventud Alianza de San Juan, Asociación Atlética Estudiantes de Río Cuarto y Club Sportivo y Biblioteca Atenas de Río Cuarto.
Por último, es importante acotar que Estudiantes es el equipo más efectivo de la fase clasificatoria sobre los 48 participantes. Con 49 puntos, y una diferencia de goles positiva de +19, los dirigidos por Hugo Mattea le sacaron en la tabla general 6 puntos a su perseguidor, que fue otro equipo cordobés: Sportivo Belgrano de San Francisco. Los "verdes" del Este de la provincia de Córdoba sumaron 43 unidades y tiene una diferencia de goles positiva de +13. El podio de los mejores de la etapa clasificatoria se completa con Cruceros del Norte de Posadas Misiones, que sumó 42 puntos en las 24 presentaciones y obtuvo una diferencia de goles de + 16.
En cuanto a los equipos que acompañarán a Estudiantes en la zona C, Juventud Alianza de San Juan terminó en la tabla general de la etapa clasificatoria en el cuarto lugar; Sportivo del Bono de San Juan en el decimocuarto lugar y Sportivo y Biblioteca Atenas en el decimoquinto.
Redacción Al Toque